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1、无菌实验室设计的各项建筑物应坚固耐用、易于维修、易于清洁，并具备能防止食品、食品接触面及内包装材料遭受污染的结构。
2、为防止交叉污染，应分别设置人员通道及物料运输通道，人员通道应按洁净室通道要求严格执行。
3、须将通向外界的管路、门窗和通风道四周的空隙完全填充，所有窗户、通风口和风机开口均应装上防护网。
4、无菌实验室的高度应能满足工艺、卫生要求，以及设备安装、维护、保养的需要。
5、无菌实验室设计地面应用无毒、防滑、不渗水、不吸水、无裂隙且易于清洗消毒的建筑材料铺砌，地面应有适当坡度。
6、屋顶和天花板应选用不吸水、表面光洁、无毒、防霉、耐腐蚀、易清洁的浅色材料覆涂。
7、食品及食品接触面暴露的上方不应设有蒸气、水、电气等辅助管道，以防止灰尘或冷凝水等落入。
8、无菌实验室的墙壁应采用不吸水、不渗水、防霉、平滑、易清洗的浅色材料构筑，用此材料装修高度应直至屋顶。
9、无菌实验室应有充足的自然采光或人工照明，加工场所工作面的混合照度不应低于300LUX，配料及灌装车间不应低于800LUX。
